远古入侵第三季出生于“老九门”世家的吴邪（李易峰 饰），因身为考古学家的父母在某次保护国家文物行动时被国外盗墓团伙杀害，吴家为保护吴邪安全将他送去德国读书，因而吴邪对“考古”事业有着与生俱来的兴趣，在一次护宝过程中他偶然获得一张记载过古墓秘密的战国帛书，为赶在不明势力之前解开帛书秘密，保护古墓中文物不受侵害。按照帛书的指引吴邪跟随三叔吴三省（张智尧 饰）、潘子（魏巍 饰）以及神秘小哥张起灵（杨洋 饰）来到鲁殇王墓探究七星鲁王宫的秘密。　　在古墓中吴邪结识了前来探秘的王胖子（刘天佐 饰）并救下身份不明的阿宁（唐嫣 饰），经过惊现刺激匪夷所思的事件之后，众人又发现了更多未解的谜团。吴邪等人在和不明势力斗智斗勇的同时又踏上了新的探秘之旅……